以方正集团研发管理制度为基础，方正微电子创建了自己的研发管理阵容，逐渐建立起了一支具有较强技术实力的研发组织。产品开发处现有各类研发人员40余人，已基本形成实现老、中、青三代搭配，阶梯型的技术组合，具备自主研发高附加值工艺平台的能力。
公司于2008成功取得了iso 9001和iso/ts 16949的质量管理双体系认证。在新品开发过程中，我们严格遵循质量体系中的apqp流程，高效地开发出数十种具有自主知识产权的工艺平台。而且到目前为止，这些工艺中的大多数已经成为fmic的核心技术。下图为fmic项目开发的一个基本流程图。
除此之外，公司在集团的支持下还大力推行产学研相结合的研发体系，成效显著。在2011年我们正式组建了由陈星弼院士领导的广东省深圳方正微电子功率集成电路院士工作站，工作站的成立为公司研发新项目提供了坚实的理论技术后盾。深港产学研基地-北京大学深圳soc重点实验室自2009年以来在方正微电子派驻技术专家，与方正微电子共同进行高压工艺平台的研究与开发。并且，2018年企业研发中心被认定为广东省功率半导体先进制造工程技术研究中心。
除自主开发新平台和新产品之外，公司还与日本、韩国、德国等国际著名半导体企业密切合作，获得他们的技术转让与授权。